根據報導，2010年女考生錄取率一度高於男考生，但從2011年後，女考生錄取率就一直低於男考生。這種刻意減招女醫科生的做法，呈現出2018年男考生錄取率8.8%、錄取141人，而女考生錄取率2.9%、錄取30人的明顯差距。目前已知，校方之所以刻意減少招收女學生，可能跟東京醫大女醫師一旦結婚或生產就會離職或留職停薪，造成東京醫大旗下醫院出現醫師不足的情況有關。東京醫大相關人士表示，說起來，這樣做是「必要之惡」，也是一種默契。相關人士也承認，女生很會考試，但離職率比男生高，才會讓校方出此下策。
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